IsomiR在ALS预后中的应用代码集

数据集概述

本数据集包含用于ALS预后中IsomiR应用相关RNA-seq数据统计分析的代码文件,涵盖数据预处理、特征提取、模型运行及结果保存等完整分析流程,支持相关生物信息学分析工作开展。

文件详解

  • 代码文件组(共12个,含Python、R、Jupyter Notebook格式):
  • Python代码文件(.py,10个):如summerize_multi_runs_main.py(多运行结果汇总)、save_model_results.py(模型结果保存)、isomiRsII_Data_analysis_tool.py(IsomiR数据分析工具)、isomiRs_pipelines_main_new_16_9_24.py(IsomiR分析主流程)、Extract_mature_data.py(成熟数据提取)、data_loaders.py(数据加载)、unified_features_from_files.py(特征统一提取)等,用于数据处理、分析及模型相关操作
  • R代码文件(.r,1个):preprocsssing_pipeline_isomiRs.R,用于IsomiR数据预处理
  • Jupyter Notebook文件(.ipynb,1个):Final_model.ipynb,可能为最终模型相关分析文件

适用场景

  • 生物信息学研究:支持ALS相关IsomiR数据分析流程复现与优化
  • 医学统计分析:辅助基于RNA-seq数据的ALS预后模型构建与验证
  • 代码工具开发:为IsomiR相关生物信息分析工具开发提供参考案例
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.7 MiB
最后更新 2025年11月30日
创建于 2025年11月30日
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