数据集概述
本数据集包含甲基细菌叶绿素A（bcl）和甲基细菌脱镁叶绿素A（bph）的力场参数，以及相关的输入输出文件，支持分子模拟与结构分析，为光合辅因子的计算化学研究提供数据基础。
文件详解
数据集为一个压缩包文件，解压后包含以下内容：
- 力场参数文件：
- cromo.tpg：拓扑定义文件，含bcl和bph的原子类型分配
- cromo.prm：力场参数文件，含价键和非键参数
- ORAC输入文件：
- bcl_start.pdb、bph_start.pdb：bcl和bph的初始PDB结构（仅重原子）
- bcl.in、bph.in：ORAC输入文件，用于结构CG最小化和谐振频率计算
- ORAC输出文件：
- bcl_min.pdb、bph_min.pdb：含氢原子的bcl和bph最小化结构
- bcl.freq、bph.freq：bcl和bph的谐振频率及特征向量
适用场景
- 计算化学研究：用于光合辅因子的分子动力学模拟与结构优化
- 生物物理分析：探究bcl和bph的结构稳定性与振动特性
- 分子模拟工具验证：作为ORAC等计算工具的测试数据集
- 光合作用机制研究：辅助分析光合系统中关键分子的结构功能关系
