数据集概述
该数据集包含基于RNA测序数据的鳉科（Fundulidae）系统基因组学分析数据，涵盖十六种内群鳉科鱼类及参考外群的152个基因的组装、拼接与比对序列，支持系统发育关系研究。
文件详解
- 核心分析文件：
- BI_Command_16species.nex、BI_Command_32species.nex：贝叶斯分析命令文件（NEX格式），用于16种及32种鱼类的系统发育树构建
- BI_GeneMatrix_16species.nex、BI_GeneMatrix_32species.nex：贝叶斯分析基因矩阵文件（NEX格式），对应不同物种数量的基因序列数据
- ML_Command_16species.txt、ML_Command_32species.txt：最大似然分析命令文件（TXT格式），记录RAxML软件运行参数
- ML_GeneMatrix_16species.fas、ML_GeneMatrix_32species.fas：最大似然分析基因矩阵文件（FAS格式），存储基因序列数据
- ML_Partitions_16species.txt、ML_Partitions_32species.txt：最大似然分析分区文件（TXT格式），定义基因序列的分区信息
适用场景
- 鱼类系统发育研究：分析鳉科鱼类的进化关系与分类地位
- 比较基因组学：探究不同鳉科物种间的基因序列差异
- 进化生物学：研究基因序列在物种分化中的演化模式
- 生物信息学方法验证：测试系统发育分析工具的性能与准确性
