数据集概述
本数据集包含酵母有丝分裂双链断裂过程中异源双链DNA(hetDNA)长度调控研究的原始测序数据及相关文件,涉及多种酵母菌株的PacBio原始测序数据和条形码序列,为解析不同基因(如mlh1、mre11等)对hetDNA长度的调控机制提供基础数据。
文件详解
- 条形码序列文件(TXT格式,共10个):
- 示例文件:Barcodes for mlh1 mre11.txt、Barcodes for mlh1.txt等
- 内容:包含各酵母菌株(如mlh1、mlh1 mre11、mlh1 rad9等)对应的正向和反向条形码序列,用于测序数据的样本识别与区分
- PacBio原始测序数据文件:
- FASTQ格式(3个):PacBio raw data_Figure 5_mlh1 exo1_mlh1 sgs1.fastq等,存储原始测序 reads 数据
- FASTA格式(3个):PacBio raw data_Figure S3_mlh1 mre11 exo1.fasta等,存储测序序列数据
- 文档文件(DOCX格式,1个):
- Table 1&2 forward and reverse barcode sequences.docx:包含表1和表2的正向、反向条形码序列详细信息
适用场景
- 分子生物学研究:解析酵母有丝分裂双链断裂修复过程中hetDNA长度的调控机制
- 基因组学分析:研究不同基因突变(如mlh1、mre11、sgs1等)对DNA修复结果的影响
- 生物信息学分析:用于PacBio测序数据的比对、拼接及变异检测等下游分析
- 遗传学研究:探究DNA修复相关基因在维持基因组稳定性中的作用机制