数据集概述
本数据集包含支持结核分枝杆菌萜烯核苷进化保留研究的全部原始数据与分析代码，可复现相关统计分析及图表生成。涵盖代谢、转录组、表型等多维度实验数据，以CSV为主要格式，辅以R代码、系统发育树及HTML报告等文件。
文件详解
- 原始数据文件（CSV格式，共12个）：
- 代谢与生长数据：如terpene_OD600.csv（菌株生长OD600值）、TbAd_AUC.csv（曲线下面积数据）、plKO3X.snrc.csv（代谢组数据）
- 转录组数据：Rv3378del_RNAseq.csv（基因缺失株转录组数据）
- 表型与实验数据：phenoKO3X.csv（表型数据）、012623_terpene_TF.csv（转录因子实验数据）、RBH_summary.csv（双向最佳匹配结果）
- 分析代码文件：
- DatasetS3.Rmd：R Markdown分析脚本，需修改文件路径运行
- terpene_functions.R、TbAd_deriv_mass.R：自定义分析函数脚本
- 系统发育与输出文件：
- outtree_noeuds.nwk、phyliptree.phy：系统发育树文件
- DatasetS3.html、DatasetS3.html.zip：分析结果HTML报告及压缩包
- 其他文件：
- README.txt：数据集说明文档
- xset3X、xsetDKOp等无扩展名文件：可能为中间数据或配置文件
适用场景
- 结核分枝杆菌代谢研究：分析萜烯核苷化合物对菌株生长的影响
- 基因功能研究：探究Rv3378等基因缺失对转录组及表型的调控作用
- 进化生物学分析：基于系统发育树研究萜烯核苷的进化保留机制
- 生物信息学方法验证：复现代谢组与转录组联合分析的统计方法
