基因功能注释预测数据集GeneFunctionAnnotationPrediction-nxnucc
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学, 生物信息学, 基因功能, 蛋白质功能, 机器学习, GO注释, 数据挖掘, 深度学习
数据概述:
该数据集包含来自蛋白质数据库的基因功能注释预测结果,记录了基因条目(EntryID)与对应的基因本体(Gene Ontology, GO)术语及其置信度。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为特定时刻的预测结果集合。
地理范围:数据覆盖范围取决于蛋白质数据库的收录范围,通常涵盖多种生物物种。
数据维度:数据集包含四个主要字段:Unnamed: 0(索引序号), EntryID(基因条目编号), term(预测的GO术语列表),Confidence(对应GO术语的预测置信度)。
数据格式:CSV格式,包含submission_bp_0807.csv、submission_cc_0802.csv和submission_mf_0802.csv三个文件,分别对应不同类型的GO术语(BP: 生物过程,CC: 细胞组分,MF: 分子功能)。
来源信息:数据来源未明确,推测为基于特定算法或模型对蛋白质数据库中的基因进行功能预测的结果。数据已进行结构化处理,方便分析和建模。
该数据集适合用于生物信息学研究,尤其是基因功能预测、GO注释分析以及相关机器学习模型的训练与评估。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学和基因组学领域的学术研究,例如,基因功能预测模型的开发与评估、GO富集分析、蛋白质功能网络构建等。
行业应用:可以为生物制药、基因检测等行业提供数据支持,特别是在基因功能分析、靶点发现、药物研发等方面。
决策支持:支持科研人员和生物技术公司在基因功能研究和药物研发中的决策制定,加速研究进程。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的实训素材,帮助学生和研究人员理解基因功能注释与预测方法。
此数据集特别适合用于探索基因功能与蛋白质结构的关联,评估不同预测方法的性能,以及构建用于预测基因功能的机器学习模型,从而提升对生物学过程的理解和药物研发的效率。