基因序列比对与转录因子结合分析数据集GeneSequenceAlignmentandTranscriptionFactorBindingAnalysis-renadalaa
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学, 生物信息学, 序列比对, 转录因子, Motif, 蛋白质结合, 生物序列, 数据分析
数据概述:
该数据集包含来自基因组学研究的序列比对和转录因子结合位点预测数据,记录了基因序列与转录因子结合的关联信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态基因组序列分析的结果。
地理范围:数据未限定地理范围,适用于通用生物序列分析。
数据维度:包括Query_ID(查询序列ID)、Target_ID(目标序列ID)、Optimal_offset(最佳偏移量)、p-value(p值)、E-value(E值)、q-value(q值)、Overlap(重叠长度)、Query_consensus(查询序列共识序列)、Target_consensus(目标序列共识序列)、Orientation(方向)等多个字段,用于评估序列比对的显著性和转录因子结合的预测。
数据格式:数据以TSV格式(制表符分隔值)存储,文件名为file_1.tsv,方便生物信息学分析工具处理。
来源信息:数据来源于生物信息学研究,旨在分析基因序列与转录因子之间的相互作用。
该数据集适合用于研究基因调控机制、转录因子结合位点预测、以及序列比对算法的评估。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学、分子生物学等领域的学术研究,如转录因子结合位点预测、基因调控网络分析等。
行业应用:可用于生物技术公司进行药物靶点发现、基因诊断试剂开发等。
决策支持:支持基因组研究领域的科研决策,帮助研究者深入理解基因调控机制。
教育和培训:作为生物信息学、分子生物学等相关课程的教学辅助材料,帮助学生掌握序列比对和转录因子结合分析的技能。
此数据集特别适合用于探索基因序列与转录因子结合的规律,帮助用户进行基因功能预测、疾病相关基因研究等。