基因转录因子信息数据集GeneTranscriptionFactorInformation-visualcomments

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数据来源:互联网公开数据

标签:基因组学, 转录因子, 基因表达, 生物信息学, 基因注释, 蛋白质编码, 数据库, 结构化数据

数据概述: 该数据集包含来自公开数据库和研究项目的基因信息,记录了与转录因子相关的基因特征。主要特征如下: 时间跨度:数据未明确标明具体时间,可视为静态基因信息快照。 地理范围:数据主要聚焦于人类基因组,涵盖全球范围内的基因研究成果。 数据维度:数据集包括基因的Ensembl ID、基因符号(symbol)、染色体位置(chr, start, end)、链方向(strand)、长度(len)、相关文献数量(n_pubmed)、通路信息(pathways_dbs)、GO注释(n_GO_BP, n_GO_CC, n_GO_MF)、基因别名(alias)、Entrez基因ID(entrezgene)、基因类型(type_of_gene)、基因名称(name)、基因摘要(summary)以及转录因子相关信息(DBD, Is TF?, TF assessment, Binding mode等)等多个维度。 数据格式:CSV格式,文件名为genes_information_mmscel_challenge_multiome_subtask_tf_info.csv,便于数据分析与生物信息学研究。数据还包含其他格式文件,如BIOGRID-ALL-4.3.195.tab3.txt(蛋白质相互作用数据)和TotalSeq_B_Universal_Cocktail_v1_140_Antibodies_399904_Barcodes.xlsx(抗体信息),为更全面的分析提供了支持。 数据来源于公开数据库和研究项目,已进行标准化和结构化处理。 该数据集适合用于基因组学、生物信息学和转录调控等领域的研究。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于基因表达调控、转录因子功能、基因组注释等方面的学术研究,例如转录因子结合位点预测、基因共表达网络构建等。 行业应用:为生物技术公司、制药企业提供数据支持,尤其在药物靶点发现、基因治疗方案设计、个性化医疗等领域。 决策支持:支持科研机构和生物信息学研究人员进行基因功能预测、疾病相关基因分析,以及药物研发过程中的靶点选择。 教育和培训:作为生物信息学、基因组学、生物学等相关专业课程的实训素材,帮助学生和研究人员深入理解基因调控机制和生物信息学分析方法。 此数据集特别适合用于探索基因与转录因子之间的相互作用关系,揭示基因表达调控的分子机制,帮助用户实现对基因功能的深入理解和预测。

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数据与资源

附加信息

字段
版本 1.0
数据集大小 115.16 MiB
最后更新 2025年5月19日
创建于 2025年5月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。