基因组序列转录因子结合位点数据集_Genomic_Sequence_Transcription_Factor_Binding_Site_Dataset
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学, 生物信息学, 序列分析, 转录因子, 结合位点, 染色体, 机器学习, 基因调控
数据概述:
该数据集包含来自基因组学研究的序列数据,记录了转录因子(TF)与基因组DNA的结合位点信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标明具体时间,通常被视为静态数据集,用于分析基因组序列与转录因子结合的静态关系。
地理范围:数据覆盖基因组序列,涵盖特定物种或细胞系,具体信息需参考原始数据来源。
数据维度:数据集包含“chrom”(染色体编号)、“region”(结合位点类型,如增强子、CTCF结合位点等)、“data”(基因组序列片段)、“class”(结合位点类别,通常为二分类,表示是否存在结合)和“TF”(转录因子名称)等字段。
数据格式:CSV格式,包含combined_100_data_true.csv、combined_200_data_true.csv和combined_40_data_true.csv三个文件,便于数据处理和分析。数据已进行标准化,方便进行后续的生物信息学分析。
该数据集适合用于研究基因调控机制,转录因子与DNA相互作用,以及基因组序列分析。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学领域的学术研究,如转录因子结合位点的预测、基因调控网络构建、基因表达调控机制研究等。
行业应用:为药物研发、基因治疗等生物技术领域提供数据支持,特别是在靶点识别、药物设计等方面。
决策支持:支持基因组学相关领域的决策制定,例如疾病风险评估、个性化医疗方案制定等。
教育和培训:作为生物信息学、分子生物学、基因组学相关课程的实训素材,帮助学生理解基因组结构与转录调控机制。
此数据集特别适合用于探索基因组序列特征与转录因子结合的内在规律,助力用户进行基因组序列分析、预测转录因子结合位点,以及深入研究基因调控机制。