基于分子与形态学证据的唇柱苣苔重评估数据集

数据集概述

本数据集围绕中国云南特有植物唇柱苣苔(Chirita umbrophila)的分类学地位展开研究,整合了核核糖体DNA(ETS、ITS)和叶绿体DNA(rpl16、rps16、trnL-F)的分子数据,以及重新采集的形态学观察数据,通过系统发育分析明确其分类归属。

文件详解

  • 分子数据文件(FASTA格式):
  • ETS.fasta:核核糖体ETS区域序列数据
  • ITS.fasta:核核糖体ITS区域序列数据
  • rpL16.fasta:叶绿体rpL16基因序列数据
  • rps16.fasta:叶绿体rps16基因序列数据
  • trnL-F.fasta:叶绿体trnL-F基因间隔区序列数据
  • 系统发育树文件(PDF格式):
  • Fig._S1_Nuclear_iqtree.pdf:核基因数据集(ETS+ITS)的最大似然树(IQ-TREE)
  • Fig._S2_Nuclear_mrbayes.pdf:核基因数据集的贝叶斯树(MrBayes)
  • Fig._S3_Chloroplast_iqtree.pdf:叶绿体基因数据集的最大似然树(IQ-TREE)
  • Fig._S4_Chloroplast_mrbayes.pdf:叶绿体基因数据集的贝叶斯树(MrBayes)
  • Fig._S5_combine_mrbayes.pdf:联合数据集的贝叶斯树(MrBayes)
  • 说明文档:
  • README.txt:数据集概述及文件说明,包含5个对齐的分子矩阵信息(2个核基因+3个叶绿体基因)

适用场景

  • 植物分类学研究:用于验证唇柱苣苔与相关物种的分类关系
  • 分子系统发育分析:提供核基因与叶绿体基因序列数据及系统发育树文件
  • 植物形态学研究:支持唇柱苣苔与紫花苣苔属物种的形态比较分析
  • 生物多样性保护:明确云南特有植物的分类地位,为物种保护提供科学依据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.67 MiB
最后更新 2025年12月9日
创建于 2025年12月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。