数据集概述
本数据集围绕中国云南特有植物唇柱苣苔(Chirita umbrophila)的分类学地位展开研究,整合了核核糖体DNA(ETS、ITS)和叶绿体DNA(rpl16、rps16、trnL-F)的分子数据,以及重新采集的形态学观察数据,通过系统发育分析明确其分类归属。
文件详解
- 分子数据文件(FASTA格式):
- ETS.fasta:核核糖体ETS区域序列数据
- ITS.fasta:核核糖体ITS区域序列数据
- rpL16.fasta:叶绿体rpL16基因序列数据
- rps16.fasta:叶绿体rps16基因序列数据
- trnL-F.fasta:叶绿体trnL-F基因间隔区序列数据
- 系统发育树文件(PDF格式):
- Fig._S1_Nuclear_iqtree.pdf:核基因数据集(ETS+ITS)的最大似然树(IQ-TREE)
- Fig._S2_Nuclear_mrbayes.pdf:核基因数据集的贝叶斯树(MrBayes)
- Fig._S3_Chloroplast_iqtree.pdf:叶绿体基因数据集的最大似然树(IQ-TREE)
- Fig._S4_Chloroplast_mrbayes.pdf:叶绿体基因数据集的贝叶斯树(MrBayes)
- Fig._S5_combine_mrbayes.pdf:联合数据集的贝叶斯树(MrBayes)
- 说明文档:
- README.txt:数据集概述及文件说明,包含5个对齐的分子矩阵信息(2个核基因+3个叶绿体基因)
适用场景
- 植物分类学研究:用于验证唇柱苣苔与相关物种的分类关系
- 分子系统发育分析:提供核基因与叶绿体基因序列数据及系统发育树文件
- 植物形态学研究:支持唇柱苣苔与紫花苣苔属物种的形态比较分析
- 生物多样性保护:明确云南特有植物的分类地位,为物种保护提供科学依据