数据集概述
本数据集包含基于连锁不平衡（LD）聚类的全基因组关联研究（GWAS）方法相关文件，涉及基因组窗口划分、LD网络分析与主成分分析的降维工具，以及适用于野生样本或双亲子代F2群体的单/多基因座关联测试模型，可用于生态遗传学定位研究，附植物（拟南芥）、鱼类（三刺鱼）公开数据集及模拟数据的方法验证文件。
文件详解
- README文件：
- 文件名称：README_for_R script and example data for cluster-based association and QTL mapping.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含基于聚类的关联和QTL定位方法的R脚本及示例数据的说明文档，解释方法原理、脚本使用流程及示例数据的背景信息。
- R脚本与示例数据压缩包：
- 文件名称：R script and example data for cluster-based association and QTL mapping.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含实现聚类关联映射方法的R脚本，以及拟南芥、三刺鱼公开数据和模拟数据等示例数据文件，支持方法的复现与应用。
适用场景
- 基因组关联研究方法验证：用于测试基于LD聚类的GWAS方法在处理高维数据、降低多重检验保守性方面的性能。
- 生态遗传学定位分析：应用于野生样本或双亲子代F2群体的数量性状关联位点检测，适配不同模型结构。
- 高维基因组数据降维研究：利用LD网络分析与主成分分析结合的降维工具，探索基因组数据的维度压缩策略。
- 关联测试模型开发：基于单/多基因座模型框架，优化高维基因组数据的关联测试计算效率。
