数据集概述
本数据集为亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究的核心数据,包含通过RADSeq技术生成的5154个高覆盖度单核苷酸多态性(SNP)位点数据,覆盖福克兰群岛、南乔治亚、克罗泽群岛及麦夸里岛的王企鹅种群。数据用于分析种群遗传结构、扩散模式及殖民化历史,揭示跨数千公里海域的王企鹅种群遗传分化极轻微的特征,为物种保护规划提供依据。
文件详解
- 文件名称:README_for_king_final_snp_dataset.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明,记录样本来源(4个地理种群的16只王企鹅血液样本,含个体ID及采样时间地点)、SNP数据生成方法及数据集核心信息。
- 文件名称:king_final_snp_dataset.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:存储5154个无连锁高覆盖度SNP位点的最终数据集,包含种群遗传分析所需的基因型信息。
- 文件名称:BayeScan_output.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:BayeScan软件分析输出结果,用于检测种群间的遗传分化位点及选择信号。
- 文件名称:filter.py
- 文件格式:PY
- 字段映射介绍:数据过滤处理脚本,用于SNP数据的质控与筛选,生成最终分析数据集。
数据来源
论文“Dispersal in the sub-Antarctic: king penguins show remarkably little population genetic differentiation across their range”
适用场景
- 海洋生物种群遗传结构分析: 研究王企鹅跨亚南极海域的种群遗传分化程度与基因流模式。
- 物种扩散与殖民化历史研究: 分析福克兰群岛新种群的来源及密度依赖扩散机制。
- 濒危物种保护规划: 为考虑种群连通性的王企鹅保护策略制定提供遗传数据支持。
- 气候变化对海洋生物影响评估: 结合遗传分化特征,预测王企鹅对南大洋生态变化的响应能力。