数据集概述
本数据集包含孔雀鱼(M. picta)LG12性别染色体对的遗传图谱与覆盖数据,基于多个自然种群的雌雄个体基因组序列,用于研究Y染色体遗传退化及基因丢失。数据涵盖性别鉴定的覆盖结果、雌雄与常染色体覆盖深度比分析文件,以及用于验证性别连锁的遗传标记基因型文件,共7个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README(revised).docx、Recall_values_tables.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集说明(README)及召回值统计表格,提供实验背景与结果指标说明
- 基因型与覆盖数据文件
- 文件名称:Microsatellite_genotypes_for_mapping_LG12.xlsx、Coverage_data.xlsx、SeqSNP_LG12_targets_(both_experiments).xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含LG12遗传图谱用微卫星基因型、性别染色体覆盖数据(雌雄覆盖深度比等)、LG12目标区域序列SNP标记(双实验)
- 序列与比对归档文件
- 文件名称:Sequences_from_Pollux_et_al..zip、Manual_alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Pollux等文献来源的序列数据及手动比对结果
适用场景
- 性别染色体遗传退化研究: 分析孔雀鱼Y染色体基因丢失及退化程度
- 性别鉴定方法验证: 利用性别染色体覆盖数据验证个体性别鉴定的准确性
- 遗传图谱构建与验证: 通过微卫星基因型数据构建并验证LG12性别连锁图谱
- 基因组覆盖深度分析: 研究雌雄个体性别染色体与常染色体的覆盖深度比(M/F、M/A、F/A)
- 分子标记开发应用: 基于SeqSNP标记数据开发LG12性别相关分子标记