LAMMPS定向动态键合框架

数据集概述

该数据集包含一个扩展后的LAMMPS框架程序，支持定向键和动态键合功能，可模拟粗粒度模型的化学反应（如DNA杂交动力学），适用于大规模原子/分子并行模拟。

文件详解

• 文件名称: aeme_v1_0.tar.gz
• 文件格式: 压缩文件（.gz）
• 文件内容: 包含扩展后的LAMMPS框架程序，支持随机形成新键、断裂现有键、键类型转换，以及动态引入角度和二面角相互作用。

数据来源

CPC Program Library（Queen's University Belfast 1969-2018）

适用场景

• 分子动力学模拟研究：用于模拟DNA杂交等动态键合过程
• 计算化学分析：支持粗粒度模型的化学反应动力学研究
• 材料科学模拟：探索定向键和动态键合对材料性质的影响
• 生物物理研究：分析生物大分子（如DNA）的结构动态变化