蓝翅鸭转录组从头组装数据集

数据集概述

本数据集提供北美蓝翅鸭的转录组从头组装数据,包含其回肠和法氏囊组织的RNAseq分析结果,涉及未感染与感染低致病性禽流感病毒H5N9的个体,共鉴定57万余转录本及44万余注释单基因,支持宿主-病原体互作等研究。

文件详解

  • Anas_discors_transcriptome_annotations.csv:CSV格式,含基因ID、转录本ID、BLAST比对结果、功能注释(Pfam、GO、KEGG等)及结构预测(SignalP、TmHMM)等字段
  • Anas_discors_de_novo_transcriptome.fasta:FASTA格式,存储转录组从头组装的核苷酸序列数据

适用场景

  • 蓝翅鸭基因表达差异分析研究
  • 禽流感病毒宿主-病原体互作机制探究
  • 禽类传染病空间分布与传播驱动力分析
  • 野生动物转录组功能注释与基因挖掘
  • 公共卫生领域人畜共患病风险评估
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 119.25 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
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