数据集概述
本数据集是第四纪岛屿物种形成地形气候模型（ITQD）研究的配套数据，针对加那利群岛大加那利岛的拉帕尔科鲁斯象鼻虫物种复合体（Laparocerus tessellatus），通过ddRAD-seq技术获取单核苷酸多态性（SNP）数据，分析其基因组关系、物种边界、种群历史及空间连接模式，验证ITQD模型对岛屿物种分化的解释力。
文件详解
- 文件名称：SplitsTree_input.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于SplitsTree软件分析的输入数据，用于构建种群遗传关系的网络结构。
- 文件名称：Arlequin_inputs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于Arlequin软件分析的输入数据，用于种群遗传学参数计算与检验。
- 文件名称：BFD_inputs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于Bayes因子物种界定（BFD）分析的输入数据，用于推断物种边界。
- 文件名称：PCA_input.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于主成分分析（PCA）的输入数据，用于探索种群遗传结构的空间分布。
- 文件名称：RAD-seq Filtered Genotypes.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含经过过滤的RAD-seq基因型数据，是后续所有分析的核心基础数据。
- 文件名称：sNMF_input.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于稀疏非负矩阵分解（sNMF）分析的输入数据，用于推断种群遗传结构与祖先成分。
数据来源
论文“A topoclimate model for Quaternary insular speciation”
适用场景
- 岛屿物种分化机制研究: 验证ITQD模型对第四纪岛屿物种（如象鼻虫）种群隔离与分化的解释力。
- 种群基因组学分析: 利用ddRAD-seq数据探究物种复合体的遗传结构、祖先种群及基因交流模式。
- 气候驱动进化研究: 分析末次盛冰期降水等气候因子对岛屿物种基因组关系的影响。
- 物种界定方法应用: 基于BFD等分析验证多物种假设，完善岛屿物种分类体系。
- 进化生物学模型测试: 为岛屿无脊椎动物进化过程的理论模型提供实证数据支持。
