数据集概述
本数据集聚焦阿根廷蚁(Linepithema humile)气味受体(ORs)的比较转录组与系统发育地层学研究,通过分析触角、头、胸、腿等组织的转录组数据,筛选出触角富集的21个九外显子OR候选基因,结合系统发育地层学方法探究其进化特征,为揭示蚂蚁巢友识别机制提供数据支撑。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据来源(关联DOI:10.5061/dryad.83bk3jb1d)、分析方法概述及数据文件说明。
- Collated_Proteome_FASTA.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:阿根廷蚁及其他昆虫的蛋白质组序列文件,用于BLASTp比对分析。
- OR_Phylostratigraphy_Final.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:气味受体基因的系统发育地层学分析结果表,包含基因进化层级、分类群关联等信息。
- Phylostratigraphy_Node_Distance.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Subject Species(研究物种)、Node Distance(节点距离)字段,记录阿根廷蚁与其他蚂蚁物种(如Temnothorax curvispinosus等)的系统发育节点距离数据。
- Table_S1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:BLASTp分析详细数据表,记录阿根廷蚁蛋白质组与30个其他物种蛋白质组的比对参数及结果。
- Phylostratigraphy_Final.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:整体系统发育地层学分析结果汇总表,包含所有分析基因的进化起源、地层分类等信息。
数据来源
Dryad数字仓库(DOI:10.5061/dryad.83bk3jb1d)
适用场景
- 昆虫嗅觉受体进化研究:分析阿根廷蚁九外显子OR基因的系统发育起源与进化路径。
- 蚂蚁巢友识别机制探究:验证触角富集OR基因是否参与体表碳氢化合物检测,揭示巢友识别的分子基础。
- 入侵物种适应性分析:研究阿根廷蚁OR基因对其入侵能力的贡献,为入侵物种防控提供理论参考。
- 比较转录组学方法应用:探索不同组织中基因表达的特异性,优化昆虫组织转录组分析流程。