数据集概述
本数据集包含海洋腹足类Littorina saxatilis的遗传与表型数据,用于研究其在基因流存在下的平行适应性进化及生殖隔离机制。数据涵盖线粒体序列、基因内含子序列、AFLP标记、形态测量及地标数据,辅以对应说明文档,支持分析表型分化、基因交换障碍及种群遗传结构,共12个文件。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:README_for_Mitochondrial sequences.xlsx、README_for_Cal-1_Final-NoIndel_Intron.xlsx、README_for_ElFac_Final-NoIndel_Intron.xlsx、README_for_ThioPer-2_Final-NoIndel_Intron.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:对应各遗传序列文件的说明文档,内容未详细提供,推测为序列数据的背景、处理方法或字段解释。
- 遗传序列文件(FASTA文件)
- 文件名称:Cal-1_Final-NoIndel_Intron.fasta、ElFac_Final-NoIndel_Intron.fasta、Mitochondrial sequences.fasta、ThioPer-2_Final-NoIndel_Intron.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含Littorina saxatilis的线粒体序列及Cal-1、ElFac、ThioPer-2基因的无插入缺失内含子序列,为遗传分析提供原始序列数据。
- 标记与表型数据文件(TXT文件)
- 文件名称:Lsaxatilis_AFLPs-1.txt、Lsaxatilis_landmarks-1.txt、Lsaxatilis_morphometrics-1.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:
- Lsaxatilis_AFLPs-1.txt:含REGION(区域)、LOCALITY(地点)、ECOTYPE(生态型:WAVE/CRAB)、INDIVIDUAL(个体)4个基础字段,及462个AFLP位点和152个AFLP异常位点的基因型(0/1表示缺失/存在);
- Lsaxatilis_landmarks-1.txt、Lsaxatilis_morphometrics-1.txt:内容未详细提供,推测为形态地标数据及形态测量数据,用于表型分析。
数据来源
论文“Parallel evolution of local adaptation and reproductive isolation in the face of gene flow”
适用场景
- 进化生物学研究:分析Littorina saxatilis在基因流背景下的平行适应性进化机制及生殖隔离形成过程;
- 种群遗传学分析:利用AFLP标记和基因序列数据,研究种群遗传结构、地理分化及基因交换模式;
- 生态适应研究:结合生态型(波浪/螃蟹栖息地)与表型、遗传数据,探究栖息地相关的适应性分化;
- 物种形成机制研究:验证自然选择在生态驱动型物种形成中的作用,评估表型分化与遗传分化的关联。