数据集概述
本数据集是论文《Diversity and evolution of chitin synthases in oomycetes》的支持数据，包含卵菌几丁质合酶（CHS）的序列、多序列比对及系统发育树文件，覆盖不同结构域、进化分支及分析工具的处理结果。
文件详解
- 序列文件：
- S1：含P1/P2分支、S1-S6分支、E. dicksonii及3个外类群的全长CHS序列
- S2：仅包含CHS的a-h基序序列
- S3a：含MIT结构域的序列
- S3b：经MUSCLE比对后提取Pfam识别结构域的MIT序列
- 多序列比对文件：
- S4a-S4c：全长CHS的Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE比对结果
- S5a-S5c：MIT结构域的Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE比对结果
- S6a-S6c：MIT结构域的Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE比对结果
- S7：生成补充图S5的多序列比对
- S9a-S9c：Pfam种子MIT结构域及上游区域的Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE比对结果（序列标识符较长）
- 系统发育树文件：
- S8a、S8b：生成补充图S7的Newick格式树文件
- 文件格式：以.fa、.phylip、.phy、.tree为主
适用场景
- 分子进化研究：分析卵菌几丁质合酶的进化关系与结构多样性
- 生物信息学方法比较：评估不同多序列比对工具（Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE）的处理结果差异
- 结构域功能分析：探究MIT结构域在卵菌CHS中的保守性与进化特征
- 论文结果复现：支持原研究中系统发育树构建、序列特征分析等实验的重复验证
