数据集概述
本数据集为2022年路易斯安那州立大学生物信息学研讨会课程材料，围绕桡足类动物盐度胁迫下的RNA-Seq数据分析展开，包含实验流程、数据分析工具使用及相关示例文件，供学员学习生物信息学分析方法。
文件详解
- 文档类文件（PDF格式，共9个）：
- 01_lsu_bioinformatics_workshop_day1.pdf、02_lsu_bioinformatics_workshop_day2.pdf、03_lsu_bioinformatics_workshop_day3.pdf、04_lsu_bioinformatics_workshop_day4-5.pdf：研讨会每日课程内容文档
- 00_workshop2022_code_of_conduct.pdf：研讨会行为准则文档
- 10_exercise_databases.pdf：数据库练习文档
- 05_exercise_galaxy.pdf：Galaxy工具练习文档
- 07_shell_scripting_v1.pdf：Shell脚本编写文档
- 08_trinity_rsem_commands.pdf：Trinity和RSEM工具命令文档
- 文本类文件（TXT格式，共2个）：
- 11_README_example.txt、README.txt：说明文档，包含研讨会基本信息、数据来源及联系人信息
- 原始数据文件（FQ格式，1个）：
- 06_N15a_v2.fq：RNA-Seq原始测序数据文件
- 压缩文件（ZIP格式，1个）：
- 09_R.zip：R语言相关文件压缩包，可能包含数据分析代码或示例脚本
数据来源
路易斯安那州立大学（Louisiana State University）
适用场景
- 生物信息学教学：作为RNA-Seq数据分析培训课程的学习材料
- 转录组数据分析实践：用于练习使用DESeq2、edgeR等工具进行基因表达差异分析
- 生物信息学工具应用：学习Galaxy、Trinity、RSEM等生物信息学工具的操作流程
- 盐度胁迫分子机制研究：基于桡足类动物的转录组数据，探索盐度胁迫下的基因表达响应机制
