数据集概述
本数据集围绕可可病原菌Moniliophthora roreri的交配基因与繁殖方式展开,包含该菌A/B交配位点的基因序列比对、系统发育分析用ITS序列比对及微卫星标记数据,用于支持其虽具有双等位基因交配位点但以克隆方式繁殖的研究结论,涉及47株全球地理分布菌株的遗传分析。
文件详解
- Gblocks alignment of pheromone receptors.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含可可病原菌M.roreri信息素受体基因的Gblocks标准化比对序列,用于基因结构与进化分析
- GBlocks alignment ITS for phylogeny.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含该病原菌内转录间隔区(ITS)序列的Gblocks标准化比对结果,用于系统发育关系构建
- Microsatellite data_M_roreri_JDiazV_MCAime.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含47株M.roreri菌株的11个微卫星标记数据,支持遗传群体结构、连锁不平衡及交配型关联分析
数据来源
论文“The cacao pathogen Moniliophthora roreri (Marasmiaceae) possesses biallelic A and B mating loci but reproduces clonally”
适用场景
- 植物病原菌遗传机制研究:分析M.roreri交配位点结构与克隆繁殖的遗传基础
- 真菌系统发育分析:利用ITS序列比对数据构建可可病原菌的进化关系
- 病原菌群体遗传学研究:通过微卫星数据解析菌株地理分布与遗传分化模式
- 农业病害防控策略制定:基于病原菌繁殖方式与传播路径研究,优化可可黑果病的防控方案