数据集概述
本数据集围绕海洋鱼类毛鳞鱼（Mallotus villosus）的局部适应机制展开，包含基因组SNP数据、产卵场环境数据及种群信息。通过分析基因流、祖先多态性和染色体重排对局部适应的影响，为理解高基因流下海洋生物的适应性进化提供支撑，共含3个核心文件。
文件详解
- 遗传数据文件：batch_4.maxmaf.pruned.whitelist3.maxmiss97.recode.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含25,904个过滤后的全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据，覆盖31个产卵场1,310个个体的基因型信息，用于种群遗传结构、染色体重排及局部适应分子标记分析
- 环境数据文件：Environmental_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录毛鳞鱼产卵场的环境参数，包含Sampling site（采样点）、Temperature（温度）、Chlorophyll（叶绿素浓度）等字段
- 种群信息文件：POP.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含31个产卵场的种群基础信息，支持遗传数据与环境数据的样本关联匹配
数据来源
论文“Shared ancestral polymorphism and chromosomal rearrangements as potential drivers of local adaptation in a marine fish”
适用场景
- 海洋鱼类适应进化研究：分析毛鳞鱼在高基因流下，祖先多态性、染色体重排对局部适应的驱动机制
- 遗传与环境关联分析：通过SNP数据与环境参数的关联，识别响应温度、叶绿素等环境因子的适应性分子标记
- 种群遗传结构解析：基于全基因组SNP数据重建毛鳞鱼冰川谱系分化历史，评估种群有效种群大小和基因流水平
- 染色体重排功能研究：探究多态性染色体重排对毛鳞鱼局部适应的遗传贡献
