数据集概述
本数据集是关于曼氏血吸虫有限生物材料自动化ChIPmentation实验的支持信息,包含实验相关的原始数据文件、报告及分析脚本,为验证实验结果提供补充材料。
文件详解
- 实验结果文件:
- CG_Ro_1_High Sensitivity DNA Assay_DE13805677_2019-06-20_09-10-48.pdf:PDF格式,用于图2的未裁剪文件
- CG_Ro_2_High Sensitivity DNA Assay_DE13805677_2019-06-20_10-12-12.pdf:PDF格式,用于图2的未裁剪文件
- gel qpcr test input sds_01.tif:TIF格式,用于图8的未裁剪文件
- qPCR报告文件:
- 20200612-1_Report.pdf:PDF格式,1µL输入和可用染色质(Row7)的qPCR报告,用于图6
- 20200919-1_Report.pdf:PDF格式,Tn5处理后SDS测试的qPCR报告,用于图7B和图8
- 20200921-1_Report.pdf:PDF格式,比较Diagenode试剂盒酶与本实验方案其他Tn5酶输入的qPCR报告
- 分析脚本压缩包:
- wilcoxon_curves.tgz:TGZ格式,包含R脚本wilcoxon_curves.Rmd、生成的wilcoxon_curves.html及相关资源
数据来源
IHPE(http://ihpe.univ-perp.fr)
适用场景
- 分子生物学实验验证:支持ChIPmentation实验结果的复现与验证
- 寄生虫学研究:分析曼氏血吸虫有限生物材料的基因调控机制
- 生物信息学分析:基于R脚本复现元基因谱比较及统计分析
- 实验方法优化:对比不同酶试剂对ChIPmentation实验的影响