数据集概述
本数据集围绕带时间戳系统发育树的不对称性测量展开，包含相关分析脚本、软件包及系统发育树文件。数据旨在解决现有系统发育不对称性检验的假阳性和假阴性问题，通过置换方法降低假阳性率，并结合不对称性剖面识别局部不对称，为病毒系统发育分析提供工具支持。
文件详解
- 分析脚本文件
- 文件名称：example-analysis-script.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：包含用于系统发育树不对称性分析的示例脚本，可能涉及数据读取、不对称性测量、置换检验及结果可视化等代码逻辑。
- 软件包文件
- 文件名称：treeImbalance_1.1.tar.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：系统发育树不平衡性分析的R软件包压缩文件，可能包含用于计算不对称性指标、生成随机树及检验的函数库。
- 系统发育树文件
- 文件名称：Trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩格式的系统发育树文件集合，包含带时间戳的病毒系统发育树数据，用于不对称性分析的实例数据。
适用场景
- 病毒系统发育不对称性分析: 利用脚本和软件包测量病毒系统发育树的不对称性，探究种群结构或传播异质性。
- 系统发育模型验证: 比较实际病毒数据集与合并、生灭过程模型的偏差，评估模型适用性。
- 局部不对称性识别: 通过不对称性剖面定位系统发育树中局部不对称区域，揭示潜在的进化事件。
- 进化生物学方法研究: 验证置换法在降低时间异质采样导致的假阳性率中的效果，优化系统发育分析流程。
