数据集概述
本数据集为论文补充数据,核心内容是硅藻分子生物监测中细胞生物量校正因子的应用相关数据,包含5个模拟群落、3次重复的原始测序数据及对应信息表,用于解决 metabarcoding 定量偏差问题,支持硅藻分子生物监测方法优化。
文件详解
- 15 fastq files raw reads (5 mock communities, 3 replicates).rar
- 文件格式:RAR
- 内容说明:包含测序平台提供的15个fastq格式原始测序文件,对应5个模拟群落、3次重复的去复用DNA原始数据(未经过生物信息学处理)
- 15 fastq files information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:包含两部分信息,一是15个fastq文件的基础信息(文件ID、模拟群落名称、重复编号、最终样本ID、原始读段数);二是构建5个模拟群落所用8种硅藻物种的显微镜估算比例(%)
数据来源
论文"Avoiding quantification bias in metabarcoding: application of a cell biovolume correction factor in diatom molecular biomonitoring"(提交至Methods in Ecology and Evolution期刊)
适用场景
- 硅藻分子生物监测方法优化:用于验证细胞生物量校正因子对metabarcoding定量偏差的校正效果
- 模拟群落测序数据分析:支持5个模拟群落、3次重复的原始测序数据的生物信息学处理与结果验证
- 硅藻物种比例估算研究:基于显微镜估算的8种硅藻物种比例数据,开展分子测序与传统形态学方法的对比分析
- 生态学定量方法改进:为生态学领域分子生物监测中的定量偏差问题提供数据支持与解决方案参考