数据集概述
本数据集为蛾类群落组装机制研究的案例数据,包含通过全长 metabarcoding 和 DNA 条形码技术获取的13,909条全长条形码序列,以及形态学、生态学性状数据、GenBank 数据库信息等,用于分析温带森林蛾类群落的组装机制(竞争或栖息地过滤),验证两种测序方法在多样性组成和群落组装机制上的一致性。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:Hao_et_al_MetaDNACommunity_README.txt、Hao_et_al_MetaDNACommunity_README-2.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(首都师范大学等机构研究者)、生成时间(20200310)等基本信息
- 形态学性状数据
- 文件名称:1.MorphologicalTraitDATA.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Number(编号)、IDs(样本ID)、Max.Wing.Width(最大翅宽)、Chest.Length(胸部长度)、Chest.Width(胸部宽度)、Abdominal.Width(腹部宽度)、Body.Length(体长)、Forewing.Length(前翅长度)、Forewing.Area(前翅面积)、Hindwing.Area(后翅面积)、FAMILY(科)、GENUS(属)、SPECIES(种)等字段
- 生态学性状数据
- 文件名称:2.EcologicalTraitDATA.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含蛾类群落的生态相关性状数据(具体字段未完全展示)
- 核基因 GenBank 数据
- 文件名称:3.NuclearGenBank.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:推测包含蛾类核基因的 GenBank 数据库信息(具体字段未完全展示)
- COI 基因 GenBank 数据
- 文件名称:4.COIGenBank.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含蛾类COI基因的 GenBank 数据库信息(具体字段未完全展示)
- 采样完整性分析脚本
- 文件名称:5.Perl_SamplingCompleteness.pl
- 文件格式:PL
- 字段映射介绍:Perl 语言编写的采样完整性分析脚本
- 所有 OTUs 序列数据
- 文件名称:6.All_OTUs.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含所有操作分类单元(OTUs)的序列数据
数据来源
首都师范大学郝梦迪、杨彩青、李一楠等研究者(通讯作者:zhangab2008@cnu.edu.cn)
适用场景
- 昆虫群落组装机制研究: 分析温带森林蛾类群落的组装机制(竞争或栖息地过滤)
- 生物多样性监测: 利用 DNA 条形码和 metabarcoding 数据评估蛾类群落的多样性组成
- 测序技术比较分析: 验证全长 metabarcoding 和 DNA 条形码在群落组装研究中的一致性
- 形态学与生态学性状关联分析: 结合形态学和生态学性状数据,探究蛾类功能性状与群落结构的关系
- 生物信息学方法应用: 利用采样完整性分析脚本等工具,开展群落生态学的生物信息学分析