数据集概述
本数据集聚焦松鸡MHC基因进化研究,包含松鸡MHC基因的序列数据和基因型数据,用于分析MHC I类和II类基因在选择压力与基因转换作用下的不同进化历史,揭示松鸡免疫系统应对胞内、胞外病原体的分子进化机制差异。
文件详解
- 序列文件(.fasta格式)
- Grouse MHC class II BLB sequences (BLB1 locus).fasta:松鸡MHC II类BLB1基因座的核苷酸序列数据
- Grouse MHC class IA sequences.fasta:松鸡MHC I类IA基因座的核苷酸序列数据
- Grouse MHC class II BLB sequences (all).fasta:松鸡MHC II类所有BLB基因座的核苷酸序列数据
- 基因型文件(.xlsx格式)
- Grouse MHC genotypes by individual (454 pyrosequencing).xlsx:基于454焦磷酸测序的个体松鸡MHC基因型数据
- Grouse MHC genotypes by individual (BLB1 locus sequencing).xlsx:基于BLB1基因座测序的个体松鸡MHC基因型数据
数据来源
论文“Contrasting evolutionary histories of MHC class I and class II loci in grouse - effects of selection and gene conversion”
适用场景
- 分子进化研究:分析松鸡MHC基因的选择压力、基因转换频率及进化差异
- 免疫遗传学研究:探究MHC I类/II类基因在病原体识别中的功能分化
- 种群遗传学分析:利用基因型数据研究松鸡种群的遗传多样性与结构
- 进化生物学教学:作为MHC基因进化机制的案例数据支持教学实践