数据集概述
本数据集包含新西兰4种雀形目鸟类的MHC基因与微卫星基因型数据,以及单变量模型分析脚本。数据对比了1884-1938年历史样本与当代种群的遗传多样性,用于研究瓶颈效应、遗传漂变对MHC多样性的影响,涉及北岛、南岛知更鸟与 saddlebacks 物种的基因型信息,共7个文件。
文件详解
- 数据文件(.xlsx格式,共6个)
- 文件名称:MHC_Genotypes_robins_North Island.xlsx、MHC_Genotypes_robins_South Island.xlsx、MHC_Genotypes_saddlebacks_North Island.xlsx、MHC_Genotypes_saddlebacks_South Island.xlsx、Microsatellite_Genotypes_robins.xlsx、Microsatellite_Genotypes_Saddlebacks.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含新西兰北岛、南岛知更鸟(robins)与 saddlebacks 物种的MHC基因Ⅱ类B基因型数据及微卫星基因型数据,记录不同地理种群的遗传标记信息
- 代码文件(.r格式,共1个)
- 文件名称:Rscript_univariate models.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于单变量模型分析的R脚本,支持对遗传多样性数据的统计建模
数据来源
论文“MHC variation reflects the bottleneck histories of New Zealand passerines”
适用场景
- 种群遗传学研究: 分析新西兰雀形目鸟类瓶颈历史对MHC基因与微卫星遗传多样性的影响
- 遗传漂变与选择压力评估: 比较历史与当代种群的遗传多样性变化,探究遗传漂变与平衡选择的作用
- 濒危物种保护遗传学: 为经历严重种群衰退的鸟类物种提供遗传多样性评估依据,支持保护策略制定
- 生物信息学分析方法验证: 利用单变量模型脚本,验证遗传标记数据分析方法的有效性