数据集概述
本数据集为绵羊副结核分枝杆菌亚种菌株JIII-386(MAP-S/type III)全基因组序列相关研究的补充材料,包含该菌株与其他MAP亚型、副结核分枝杆菌复合体菌株的基因组比较分析结果,涵盖非编码RNA、原噬菌体区域、毒力相关基因等多维度数据。
文件详解
该数据集包含27个文件,具体说明如下:
- 核心数据文件(CSV格式,25个):
- 示例文件:Table_S5.csv、Table_S9g.csv、Table_S11c.csv等
- 内容涵盖:ncRNA与核糖开关列表、JIII-386新增基因、原噬菌体区域基因内容、转座元件拷贝数、毒力相关基因列表、基因组岛及预测功能、核心基因组与泛基因组分析结果等
- 字段示例(以Table_S5.csv为例):包含菌株名称、基因描述、参考信息、对应基因座标签等字段
- 文本文件(1个):
- Table_S1b.txt:具体内容未提供预览
- 图片文件(1个):
- Figure_S1.JPG:可能为基因组比较分析相关的可视化结果图
适用场景
- 分枝杆菌基因组学研究:分析MAP菌株基因组的镶嵌结构及亚型间差异
- 病原微生物进化研究:探究MAP-S与MAP-C基因组多样性及进化关系
- 毒力机制研究:识别不同MAP亚型毒力相关基因的分布与功能差异
- 比较基因组学分析:验证基因组岛、转座元件等结构元件对菌株表型的影响
- 微生物分子流行病学研究:为MAP菌株分型及溯源提供基因组数据支持