绵羊免疫相关长链非编码RNA转录组学荟萃分析数据集

数据集概述

本数据集为绵羊免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)转录组学荟萃分析研究的补充数据,包含lncRNA注释文件、基因表达量数据及研究相关的补充表格与材料,支持对绵羊免疫应答中lncRNA功能的深入分析。

文件详解

  • 基因注释文件(GTF格式):
  • lncrnas.gtf:所有新发现lncRNA转录本的注释文件
  • lncrnas_evidence.gtf:高置信度lncRNA基因的注释文件
  • lncrnas_remapped_v2.gtf:基于ARS-UI_Ramb_v2.0基因组重新映射的lncRNA转录本注释文件
  • 基因表达量文件:
  • rawcounts.csv:扩展注释的原始计数估计值
  • tpmcounts.csv:扩展注释的转录本每百万读数(TPM)值
  • 补充数据表(XLSX格式):
  • 包括样本信息、lncRNA分类、序列保守性、共表达分析等6个补充表格(如Supplementary_table_1_samples.xlsx)
  • 补充材料文件:
  • Supplementary_Material.pdf:发表文章的补充材料文档

适用场景

  • 绵羊免疫学研究:分析免疫应答相关lncRNA的表达模式与功能
  • 转录组数据分析:探索lncRNA在绵羊免疫反应中的调控机制
  • 基因组注释研究:完善绵羊基因组中lncRNA的注释信息
  • 生物信息学方法应用:验证lncRNA识别、表达定量及功能预测的分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 516.44 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。