免疫细胞基因表达谱分析数据集ImmuneCellGeneExpressionProfileAnalysisDataset-rezarafiee
数据来源:互联网公开数据
标签:基因表达, 免疫细胞, 肿瘤微环境, 基因组学, 生物信息学, 数据挖掘, 临床研究, 癌症研究
数据概述:
该数据集包含来自TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)数据库的免疫细胞基因表达谱数据,记录了不同癌症样本中免疫细胞的基因表达水平,旨在研究肿瘤微环境中的免疫细胞组成和功能。主要特征如下:
时间跨度:数据生成时间为2009年,但数据集本身可能包含多个时间点的数据,具体时间信息依赖于TCGA数据库的原始数据。
地理范围:数据来源于TCGA数据库,覆盖多个癌症类型,样本来源地不限,取决于TCGA项目所包含的样本。
数据维度:数据集包含多个样本的基因表达数据,每个样本具有多个基因的表达量信息,以及免疫细胞亚型信息。
数据格式:CSV格式,文件名为“ICW2_Dataset_CSC3062_2009_440_6ImmuneSubtypes_NoMissing_RR011119.csv”,方便进行数据分析和处理。
来源信息:数据来源于公开的TCGA数据库,经过了预处理和标准化,移除了缺失值,并根据免疫细胞亚型进行了分组。
该数据集适合用于免疫细胞基因表达、肿瘤微环境研究以及癌症相关的生物信息学研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、免疫学、肿瘤学等领域的学术研究,例如免疫细胞在肿瘤发生发展中的作用、不同癌症类型的免疫细胞组成差异等。
行业应用:可用于药物研发,特别是免疫治疗药物的靶点筛选和疗效预测,以及开发基于免疫细胞特征的诊断方法。
决策支持:支持临床医生进行肿瘤免疫治疗方案的制定,以及评估治疗效果。
教育和培训:作为生物信息学、基因组学、免疫学等相关课程的教学案例和实验数据,帮助学生理解基因表达、免疫细胞功能和肿瘤微环境之间的关系。
此数据集特别适合用于探索不同癌症类型中免疫细胞的异质性,以及免疫细胞与肿瘤发生、发展和预后的关联,从而促进癌症的早期诊断、个性化治疗和药物研发。