数据集概述
本数据集聚焦于南部阿巴拉契亚山脉特有濒危物种云杉冷杉苔藓蜘蛛(Microhexura montivaga)的遗传分化研究。包含线粒体与核基因序列数据、形态学资料及多物种 coalescent 分析结果,揭示该物种六个隔离种群的遗传结构与形态保守性,为其保护提供科学依据,共含8个文件。
文件详解
- 遗传分化数据文件
- 文件名称:Microhex_noc5c6_nonStandardPOFADdistances.txt、Microhex_noc5c6_StandardPOFADdistances.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:POFAD生成的遗传距离矩阵,包含标准化与非标准化种群遗传距离数据,用于分析种群间遗传分化程度
- 系统发育分析文件
- 文件名称:RAxML_COI_bipartitions.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:基于COI基因的RAxML系统发育树文件,包含分支支持率信息,反映种群间系统发育关系
- 存档压缩文件
- 文件名称:Morphology_Plates_Archive.zip、Microhexura_Assemblies.zip、PhasedMatrices_Archive.zip、RAxML_nuclear_tre_files.zip、STRUCTURE_input_output.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:分别包含形态学图片、基因组组装数据、相位矩阵、核基因系统发育树文件、STRUCTURE分析输入输出数据
数据来源
论文“Sky island diversification meets the multispecies coalescent – divergence in the spruce-fir moss spider (Microhexura montivaga, Araneae, Mygalomorphae) on the highest peaks of southern Appalachia”
适用场景
- 濒危物种保护规划: 基于遗传分化结果制定云杉冷杉苔藓蜘蛛种群保护策略,明确优先保护单元
- 种群遗传结构分析: 研究隔离种群间的基因流与遗传分化模式,揭示地理隔离对物种演化的影响
- 系统发育与分类学研究: 结合形态学与分子数据探讨隐存种形成可能性,完善物种分类体系
- 保护遗传学方法优化: 评估多物种 coalescent 方法在片段化生境物种研究中的适用性,提升保护遗传学分析准确性