数据集概述
本数据集围绕窄口蛙（Microhylidae科）的系统发育关系研究构建，包含通过锚定系统发育组学测序（66个保守基因位点）和Sanger测序（7个基因位点）生成的多组分子数据，覆盖48至142个分类群，旨在评估特征采样、分类群采样等因素对系统发育推断的影响。
文件详解
- 补充材料文档
- 文件名称：Supporting Informatoion - Text S1.docx、Supporting Information - Text S2.txt、Supporting Information - Text S3
- 文件格式：DOCX、TXT、无扩展名
- 字段映射介绍：包含研究方法细节（如序列修剪模式）、补充分析说明等文本内容
- 补充表格
- 文件名称：Supporting Information - Table S1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：可能包含分类群列表、基因位点信息、测序数据统计等结构化表格内容
- 分析脚本
- 文件名称：Peloso-etal2015-Scripts.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：包含用于系统发育分析的计算脚本文件
- 原始序列比对文件
- 文件名称：Raw_alignment.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：包含未处理的DNA序列比对原始数据
- 数据集文件
- 文件名称：Datasets.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：包含用于分析的多组分子数据集（涵盖不同基因位点和分类群数量组合）
- 系统发育树文件
- 文件名称：Trees.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：包含通过不同分析方法（最大似然法、简约法等）推断得到的系统发育树结果
数据来源
论文“The impact of anchored phylogenomics and taxon sampling on phylogenetic inference in narrow-mouthed frogs (Anura, Microhylidae)”
适用场景
- 两栖动物系统发育关系研究：分析窄口蛙科亚科间及属级分类单元的系统发育关系稳定性
- 分子系统发育方法评估：比较锚定系统发育组学与Sanger测序、不同分析方法（最大似然法/简约法）对系统发育推断结果的影响
- 分类群与特征采样策略优化：探究分类群数量、基因位点数量对系统发育树分辨率和支持度的作用
- 生物信息学分析流程验证：利用脚本文件复现系统发育分析过程，验证方法的可重复性
- 两栖动物分类学修订：基于系统发育结果辅助窄口蛙科的分类单元界定与亚科划分更新
