数据集概述
本数据集包含论文中海洋微生物Micromonospora spp BRA006代谢基因组学研究的补充表格与预处理数据,涉及菌株基因组注释、代谢物注释及分析流程文件,共7个文件,支持对该菌株的基因组特征与代谢组结果的验证分析。
文件详解
- 基因组注释表格
- 文件名称:Sup_table1_PROKKA_BRA006_illumina.tsv、Sup_table2_PROKKA_BRA006_minion.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含locus_tag(基因座标签)、ftype(特征类型)、length_bp(长度)、gene(基因名)、EC_number(酶编号)、COG(同源簇)、product(产物)等基因组注释信息
- 代谢物注释表格
- 文件名称:Sup_table3_annotated_compounds.docx
- 文件格式:DOCX
- 内容介绍:论文补充表格3,记录注释的化合物信息
- 预处理数据文件
- 文件名称:bra006_paper_integracao_metadata.csv、bra006_paper_integracao_quant.csv
- 文件格式:CSV
- 内容介绍:分别为整合分析的元数据与定量数据文件
- 分析流程与质谱文件
- 文件名称:bra_006_batchmode_mzmine3_new.xml、bra006_paper_integracao.mgf
- 文件格式:XML、MGF
- 内容介绍:MZmine3批量分析流程配置文件与质谱数据文件
数据来源
论文“Characterization of a novel marine isolate Micromonospora spp BRA006 through a metabologenomics approach”
适用场景
- 海洋微生物基因组学研究: 分析Micromonospora spp BRA006菌株的基因结构与功能注释
- 微生物代谢组学分析: 基于预处理数据与注释表格研究菌株的代谢物组成与特征
- 代谢基因组学整合分析: 结合基因组与代谢组数据探索菌株的代谢通路机制
- 微生物资源开发: 为海洋微生物天然产物挖掘与生物技术应用提供数据支持