mlCOIintF_jgHCO2198_Based_线粒体COI短片段元条形码数据_珊瑚礁鱼类肠道分析

数据集概述

本数据集为基于新设计的mlCOIintF和jgHCO2198引物组的线粒体COI短片段(313 bp)元条形码数据,用于分析珊瑚礁鱼类(天竺鲷科、金鳞鱼科)肠道内容物的后生动物多样性。包含测序数据及OTU分类汇总结果,支持物种检测与生物多样性研究。

文件详解

  • 文件名称:Nocturnal.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:包含通过mlCOIintF/jgHCO2198引物组扩增得到的线粒体COI短片段测序序列,用于物种分类鉴定的基础数据。
  • 文件名称:Nocturnal_OTUs_summary.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含16份鱼类肠道样本中334个后生动物猎物操作分类单元(OTU)的汇总信息,涵盖OTU所属门级分类、参考条形码匹配率及贝叶斯分类结果等数据。

数据来源

论文“A new versatile primer set targeting a short fragment of the mitochondrial COI region for metabarcoding metazoan diversity: application for characterizing coral reef fish gut contents”

适用场景

  • 后生动物多样性元条形码研究:利用COI短片段引物组数据,开展环境样本或肠道内容物的物种组成分析。
  • 珊瑚礁鱼类食性分析:通过肠道内容物OTU汇总数据,研究天竺鲷科、金鳞鱼科鱼类的摄食偏好与食物网结构。
  • 线粒体COI引物性能验证:评估mlCOIintF/jgHCO2198引物组在跨后生动物类群中的扩增效率与分类准确性。
  • 生物多样性监测应用:支持大规模生物多样性评估,为生态系统健康监测提供分子数据支撑。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 9.27 MiB
最后更新 2026年1月1日
创建于 2026年1月1日
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