数据集概述
本数据集记录癌症衍生细胞系与正常细胞中,长程沉默结构域侧翼的单等位基因染色质构象数据。通过对染色质DNA进行基因分型,分析乙酰化与甲基化组蛋白H3K9免疫沉淀样本的B等位基因频率差异,经验证确认峰值区域为单等位基因结构域,揭示正常与癌细胞中染色质构象特征。
文件详解
- 数据文件(.xls格式,共22个)
- 文件名称:Chr3.xls、chr20.xls、Chr8.xls、chr19.xls、chr15.xls、Chr6.xls、Chr7.xls、chr17.xls等(覆盖不同染色体)
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含单核苷酸多态性(SNP)滑动窗口平均的B等位基因频率差异数据,反映不同染色体区域的单等位基因染色质构象特征
- 说明文档(.docx格式,1个)
- 文件名称:README_for_Chr1.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供数据集的说明信息,可能包含数据采集方法、分析流程、字段定义等内容
适用场景
- 表观遗传学研究:分析正常与癌细胞中染色质构象的单等位基因特性及其对基因表达的调控机制
- 癌症表观遗传机制研究:探索癌症细胞中染色质构象的异常变化,为癌症发生发展机制提供数据支持
- 正常细胞表观遗传调控研究:揭示正常肠道上皮细胞中可遗传的多态性单等位基因结构域特征
- 染色质开放与关闭区域边界分析:研究单等位基因结构域在染色质开放与关闭区域边界的分布规律