数据集概述
本数据集包含两种近交系小鼠（NOD/ShiLtJ与C57Bl/6J） reciprocal F1杂交后代的实验原始数据与统计分析结果，聚焦亲代起源及围产期饮食对小鼠全脑基因表达与精神疾病模型行为的影响，共含17个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：File_S1_README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集所有文件的详细说明文档
- 参考类文件
- 文件名称：File_S2_mm10.chrom.sizes
- 文件格式：.sizes
- 字段映射介绍：包含mm10基因组各染色体/ contig名称及大小，列1为染色体名称，列2为大小
- 数据类文件
- 文件名称：File_S12_behaviorModels.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含行为学实验模型公式，如lightdark实验的总距离、黑暗区域总距离等行为指标的线性混合模型公式
- 文件名称：File_S13_MatNut_validation_samplelist_072516.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本ID、品系、饮食、实验流程、批次、是否用于微阵列、RNA提取状态等样本信息
- 压缩类文件
- 文件名称：File_S9_MoGene-1_0_st-v1_probeinfo_b.txt.zip、File_S4_Snord.zip、File_S16_microarray_model_results.zip、File_S6_nod.b6.variants.csv.zip、File_S7_breeding.zip、File_S14_qpcrData.zip等共12个压缩文件
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含微阵列探针信息、Snord数据、微阵列模型结果、品系变异数据、育种数据、qPCR数据等
- 结果类文件
- 文件名称：File_S17_sexratio_results.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含性别比例统计结果，列含变量、自由度、偏差、残差自由度、残差偏差、P值等
适用场景
- 生物医学研究: 分析亲代起源与围产期饮食对小鼠行为及基因表达的交互作用
- 精神疾病模型研究: 利用行为学数据探究饮食与遗传背景对精神疾病相关行为的影响机制
- 基因表达调控研究: 通过全脑基因表达数据解析亲代起源效应下的基因调控网络
- 营养学与遗传学交叉研究: 研究围产期饮食在不同遗传背景下对后代表型的塑造作用
- 实验设计参考: 为类似亲代起源与环境因素交互作用的动物实验提供设计与数据分析模板
