数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1444品系egl-2(n693)V突变体的行为实验数据,包含成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为记录,由MRC分子生物学实验室完成,数据用于研究该基因突变体的行为特征。
文件详解
- 特征数据文件:
- 文件名称:egl-2 (n693)V on food R_2010_09_17__15_47_1087_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征信息
- 行为数据压缩包:
- 文件名称:egl-2 (n693)V on food R_2010_09_17__15_47_1087.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,格式为wcon(线虫行为数据标准格式)
- 核心数据文件:
- 文件名称:egl-2 (n693)V on food R_2010_09_17__15_47_1087.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,包含26751个分割骨架数据,对应总时长898.967秒、帧率30.03帧/秒的视频记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析egl-2(n693)V突变体的行为表型,探究该基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 行为生物学实验: 基于视频提取的骨架数据和行为特征,研究线虫的运动模式、觅食行为等
- 生物信息学分析: 利用HDF5格式的特征数据,开展线虫行为特征的量化分析与建模
- 实验方法验证: 参考实验方案(Yemini et al.方法),验证线虫行为学实验的标准化流程
- 基因功能研究: 结合突变体信息,研究egl-2基因在神经肌肉调控中的功能