数据集概述
本数据集围绕黏细菌Myxococcus xanthus的合作进化展开，包含合作基因型分化、欺骗抗性及突变表型分析的相关数据。研究聚焦自然合作菌株与实验室进化菌株对csgA缺陷型欺骗者的抗性差异，以及遗传背景对突变表型的影响，为微生物社会行为进化研究提供支持。
文件详解
- 说明文档类
- 文件名称：README.rtf、csgA_sequences_tree_Galaxy1_tree_protocol.docx
- 文件格式：RTF、DOCX
- 字段映射介绍：README.rtf为数据集说明文档；docx文件记录csgA序列进化树构建的实验方案
- 序列数据类
- 文件名称：csgA_sequences_tree_csgA_sequences.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含黏细菌不同菌株的csgA基因序列信息，用于进化分析
- 实验数据类（CSV格式，共5个）
- 文件名称：data_MLmutations.csv、data_GJV2NI.csv、data_DK5208NI.csv、data_DK5208ML.csv、data_csgA413.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录菌株突变信息（如突变数量、基因区域分布）、孢子形成实验计数数据（如菌株、抗生素处理、稀释度、菌落形成单位CFU）等实验结果
数据来源
论文“Allopatric divergence of cooperators confers cheating resistance and limits the effects of a defector mutation”
适用场景
- 微生物合作进化研究: 分析黏细菌合作基因型分化对欺骗抗性的影响机制
- 欺骗者表型可塑性分析: 探究不同遗传背景下csgA突变产生欺骗表型的差异
- 进化遗传学研究: 利用突变数据解析实验室进化菌株的遗传变化与表型关联
- 微生物社会行为生态分析: 研究自然环境中黏细菌合作菌株的地理分化模式
- 分子进化分析: 通过csgA序列数据构建进化树，分析基因进化关系
