数据集概述
本数据集是针对“纳洛昔醇作为β-微管蛋白结合抑制剂深度评估的动态评分方法”研究的计算机辅助药物设计（CADD）与分子动力学（MD）操作数据，包含受体制备、虚拟筛选、ADMET分析等多环节文件，为药物作用机制研究提供支持。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下：
- 补充文档:
- Supplementary Information.pdf: PDF格式，可能为研究的补充说明文档
- 受体制备文件（位于1- Receptor Preparation/目录下）:
- Ramachandran plot of 6I2I.pdf: PDF格式，6I2I蛋白的拉曼图
- Pocket (A) Grid Coordinates and Radius.docx: DOCX格式，结合口袋的网格坐标与半径信息
- 6i2i with B-Tubulin and PTX.pdb、6I2I Original.pdb、6I2I Prepared for VS.pdb: PDB格式，β-微管蛋白相关的蛋白结构文件
- 虚拟筛选文件（位于2- Virtual Screening/目录下）:
- 分(A)-(D)类药物数据集（如FDA批准药物），包含results.sdf、list.sdf等SDF格式文件及BBB Blood Brain Barrier.jpg/png等图片文件
- ADMET分析文件（位于3- ADMET, BBB, GI, Pgp & Lead Opt/目录下）:
- ADMET 1-30.csv: CSV格式，高评分配体的ADMET数据
- 18a Naloxegol 0 ADME radar.png等图片文件: PNG格式，纳洛昔醇衍生物的ADME雷达图
- ADME 18a-h and PTX.csv: CSV格式，衍生物与紫杉醇的ADME数据对比
- 分子对接文件（位于4- Docking/目录下）:
- All Binding Modes (Results).chimerax: Chimerax格式，结合模式结果文件
- clusters.dock4.csv: CSV格式，对接聚类结果
- Selected Mode (17,2 and 1,147).pdb等PDB格式文件: 选定结合模式的蛋白结构
- 其他分析文件:
- QSPR - Data and Plots.xlsx: XLSX格式，定量构效关系数据与图表
- Normalized Data.xlsx: XLSX格式，分子动力学描述符的归一化数据
- 1-Score Function 1 Ligand intrinsic properties.xlsx等XLSX格式文件: 配体特性、蛋白-配体特性及最终评分数据
适用场景
- 药物化学研究: 分析纳洛昔醇作为β-微管蛋白抑制剂的作用机制
- 计算机辅助药物设计: 验证动态评分方法在药物结合能力评估中的应用
- 药物ADMET性质预测: 研究药物的吸收、分布、代谢、排泄与毒性特征
- 分子动力学模拟: 探索药物与靶点蛋白的动态相互作用
- 药物优化研究: 基于纳洛昔醇衍生物的结构优化与活性分析
