数据集概述
本数据集包含2020年11月至2021年9月南非比勒陀利亚某三级医院孕妇分娩时碳青霉烯耐药肠杆菌科（CRE）定植的基因组流行病学与耐药组分析数据，涵盖临床表型、基因组、系统发育及比较分析等内容，无患者识别信息，为抗菌药物耐药研究、流行病学监测等提供支持。
文件详解
- 临床与表型数据文件：
- Dataset 1=Demographics.xlsx：Excel格式，包含患者人口统计学、分娩结局、抗菌药物暴露等临床元数据
- 基因组数据汇总文件：
- Dataset 2=Genomics.xlsx：Excel格式，汇总CRE分离株的基因组注释信息，包括耐药基因、质粒复制子类型等
- 系统发育分析文件：
- Dataset 3 = Phylogenetics.xlsx：Excel格式，包含核心基因组比对、SNP距离矩阵等系统发育相关数据
- 图表与附录文件：
- 图片文件（.tif、.png、.jpg格式）：共41个，包含系统发育树、质粒图谱、BLAST环图等可视化结果，如Figure 3.tif、Figure S5H pECl-5.2 circular plasmid.png
- 文档文件：
- Appendix-BLASTFigs.pdf：PDF格式，BLAST分析结果附录
- Supplementary Figures.docx：Word格式，补充图表说明文档
适用场景
- 抗菌药物耐药基因组学研究：分析CRE耐药基因、质粒及水平转移机制
- 流行病学监测：探究南非孕妇群体CRE定植的传播模式与进化关系
- 生物信息学方法开发：用于基准测试基因组分析流程或训练耐药预测模型
- 母婴健康研究：评估CRE对母婴分娩结局及新生儿健康的潜在影响
- 全球耐药菌传播研究：结合全球参考基因组分析CRE的国际传播动态
