数据集概述
本数据集围绕南极毛皮海豹（Arctocephalus gazella）幼崽展开，分析中性与免疫基因位点杂合性对细菌性感染致死率的影响。包含234只个体的基因分型数据、死亡率分类及统计分析结果，为研究杂合性与适合度相关性（HFCs）提供实证支持。
文件详解
- 数据文件：
- data.xlsx：Excel格式，可能包含幼崽基因分型、健康状态等核心数据
- Supplementary Table S1.csv：CSV格式，字段含contig.name（contig名称）、ssr.type（微卫星类型）、ssr.seq（微卫星序列）等，记录免疫微卫星标记信息
- Supplementary Table S2.csv：CSV格式，字段含Contig（contig编号）、Length（长度）、Forward-primer（正向引物）等，记录引物设计数据
- immune_microsats_raw.csv：CSV格式，免疫微卫星原始基因分型数据
- 结果文件：
- pvalues.txt：TXT格式，包含统计检验的p值结果
- arc_gaz_transcriptome_annotations.txt：TXT格式，南极毛皮海豹转录组注释信息
- transcriptlength.txt：TXT格式，转录本长度数据
- 文档与代码文件：
- Supplementary File S1_R_Markdown.Rmd/PDF：R代码与分析报告，记录数据分析流程
- Supplementary Table S3/S4.docx：Word格式，补充表格文档
- ImmuneMicrosats_supplementary.Rproj：R项目文件，用于复现分析
- p3_in_fur_seal.pl：Perl脚本，可能用于数据处理
- arc_gaz_transcriptome.fasta.misa/misa2：转录组微卫星识别结果文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析杂合性与适合度相关性（HFCs）的分子机制
- 保护生物学研究：评估基因多样性对物种生存的影响
- 分子生态学研究：比较中性与功能基因位点对生存适合度的贡献
- 统计方法验证：检验杂合性分析在野生动物种群研究中的应用价值
