Neisseria_gonorrhoeae_Based_淋病奈瑟菌基因组多样性数据集_2024

数据集概述

本数据集为淋病奈瑟菌的整理基因组数据，旨在捕捉当前流行群体中已知的基因组多样性。数据包含欧洲核苷酸档案库的Illumina原始测序数据、Genbank的完整基因组以及葡萄牙国家卫生研究所测序的基因组，截至2024年4月30日。数据集提供样本元数据及基因组统计摘要报告，用于cg/wgMLST方案构建。

文件详解

• 文件名称：CENTAUAR_NG_DATASET.xlsx
• 文件格式：XLSX
• 字段映射介绍：包含样本的基础元数据（如来源国家、采集日期），以及INNUca v4.2.2流程各步骤的基因组统计综合报告，如质量控制、污染评估、组装及优化的相关数据。

适用场景

• 淋病奈瑟菌基因组多样性研究：分析当前流行菌株的基因组变异特征及进化关系。
• cg/wgMLST方案构建：为淋病奈瑟菌的核心基因组/全基因组多位点序列分型方案开发提供数据支持。
• 基因组质量控制方法验证：基于INNUca流程的结果，评估淋病奈瑟菌基因组数据处理的标准化流程。
• 公共卫生监测：通过样本元数据及基因组数据，支持淋病奈瑟菌的流行趋势及传播路径分析。