数据集概述
本数据集是neXtProt蛋白激酶功能门户提供的蛋白质功能信息资源，包含蛋白质功能的注释三元组（蛋白质主体、关系描述、功能/定位/属性对象），以及相关的元数据文件，共8个文件，支持生物信息学领域对蛋白质功能的研究与分析。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：
Caloha_readme.txt.txt、README.txt、LICENSE.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集说明、版权声明（CC BY 4.0协议）、使用指引及联系信息
- 本体类文件
- 文件名称：
caloha.obo、cv_protein_property.obo、cv_modification_effect.obo
- 文件格式：OBO
- 字段映射介绍：定义蛋白质功能注释相关的本体术语，用于标准化注释内容的分类与描述
- 数据类文件
- 文件名称：
protein_kinase_function_portal.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：存储蛋白质功能注释的结构化数据
- 文件名称：
protein_kinase_function_portal.csv.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含蛋白质功能注释的核心字段，如Accession number（登录号）、Protein（蛋白质）、Relation（关系）、Object（对象）、Data confidence（数据置信度）、Evidence codes（证据代码）、Reference（参考文献）、Protein origin（蛋白质来源）等
数据来源
SIB - Swiss Institute of Bioinformatics（瑞士生物信息学研究所）
适用场景
- 蛋白质功能注释研究：利用注释三元组数据，分析蛋白质的功能、亚细胞定位及属性特征
- 生物信息学本体构建：基于OBO文件的本体术语，优化蛋白质功能注释的标准化体系
- 蛋白激酶功能分析：针对激酶类蛋白质的功能关系与实验证据，开展专项生物医学研究
- 实验数据验证：通过CSV文件中的实验系统、细节及置信度信息，验证蛋白质功能的实验依据可靠性
