数据集概述
本数据集包含与NMED-A140141项目相关的RMD分析脚本、关联RDS文件、数据集、FISH元数据及Biorender许可证信息，用于支撑论文数据分析的可重复性。提供了补充表格与分析脚本的映射关系，涵盖队列描述、去污染流程、分类群分布等多个分析模块，对应论文中的图表生成。
文件详解
- 文件名称：clinical_data_phyloseq.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含临床数据相关的phyloseq对象数据，需与"physeq"、"physeq_glom13"、"merged_phy"、"remove_control_final"、"remove_oct_final"等对象配合使用，用于队列描述分析。
- 其他关联文件（根据描述）：
- RMD脚本文件：包含Cohort_description_MTB、Decontamination_pipeline等7个分析脚本，对应生成论文图表及补充表格
- RDS文件：支撑脚本运行的关联数据对象文件
- FISH数据文件：包含FISH元数据及图像文件
- Biorender许可证文件：提供图表使用的许可证信息
数据来源
NMED-A140141项目相关研究论文
适用场景
- 生物信息学分析可重复性验证：用于复现论文中的队列描述、分类群分布等分析结果
- 医学数据分析流程参考：为类似医学研究提供去污染流程、肿瘤与正常组织比较等分析的脚本模板
- 临床数据可视化研究：利用脚本生成的图表（如冲积图、火山图）进行临床数据可视化方法参考
- 微生物组研究：通过分类群分布分析脚本，支撑微生物组与疾病关联的研究
