数据集概述
该数据集为Noecker等人2023年(待发表)关于人类肠道微生物Eggerthella lenta代谢生态位的系统生物学研究提供图表复现用的处理后数据,包含42个文件,涵盖菌株代谢、生长实验等多维度数据。
文件详解
- 核心数据文件(共41个):
- 40个TSV格式文件(占比95.24%):如figureS7B_strainConservationKOs.tsv(含Rxn、Gene、locus_tag等代谢相关字段)、figure3B_topSubsysRxns.tsv、figure2A_growth.tsv等,覆盖菌株保守性、代谢通路、生长实验等图表对应数据
- 1个XLSX格式文件:figureS8D_MS1_RibitolExactMass.xlsx(核糖醇精确质量数据)
- 文档文件(共1个):
- 1个PDF格式文件:figure3DE_LOO_FBA_comparison.pdf(FBA比较结果文档)
适用场景
- 微生物代谢研究:分析Eggerthella lenta菌株代谢通路保守性与生长特性
- 系统生物学验证:复现该研究中肠道微生物代谢生态位相关图表
- 组学数据整合:结合代谢组学原始数据(Metabolomics Workbench PR001620)开展深入分析
- 生物信息学方法应用:利用公开代码复现或扩展图表生成流程