数据集概述
本数据集包含通过下一代测序技术开发的巴塔哥尼亚森林南水青冈属(Nothofagus)物种基因组资源,涵盖叶绿体、线粒体及核基因的组装与注释结果,以及单核苷酸多态性(SNP)和简单序列重复(SSR)标记等分子遗传资源,为该属物种的遗传研究与资源管理提供支持。
文件详解
- README_for_Nothofagus_assemblies.txt
- 文件格式:TXT
- 内容介绍:数据集说明文档,包含文件结构、组装方法及资源用途等关键信息
- Nothofagus_assemblies.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容介绍:包含三个子文件夹(Notho_clip4、Nn_clip4、No_clip4),每个文件夹内有两类文件:
- info_callparameters.txt:记录MIRA组装软件的命令行参数
- info_assembly.txt:包含组装的基本信息,分为大contig信息和其他组装相关内容
数据来源
论文“Development of genomic resources for Nothofagus species using next-generation sequencing data”
适用场景
- 植物基因组学研究:分析南水青冈属物种的基因组结构、基因功能及细胞器基因组特征
- 分子遗传学分析:利用SNP和SSR标记开展物种遗传多样性、种群结构及亲缘关系研究
- 物种保护与管理:为南水青冈属物种的自然种群保护、杂交事件监测提供分子工具
- 分子标记开发:基于SSR位点信息设计特异性引物,用于物种鉴定与遗传作图
- 进化生物学研究:探究该属物种的适应性进化、种群动态及杂交起源等进化事件