OEP00002321单细胞RNA测序计数矩阵数据集

数据集概述

本数据集包含OEP00002321项目中6个单细胞RNA测序样本的原始与过滤计数矩阵,以及CellRanger软件生成的网页摘要文件,用于展示单细胞基因表达数据的处理结果。

文件详解

该数据集包含43个文件,具体说明如下: - 原始数据文件(.gz格式): - 以"raw"为后缀的文件,如F59_raw_features.tsv.gz、F31W_raw_barcodes.tsv.gz、F59_raw_matrix.mtx.gz,存储原始基因表达计数信息 - 过滤数据文件(.gz格式): - 以"filtered"为后缀的文件,如F59_filtered_matrix.mtx.gz、F62W_filtered_matrix.mtx.gz、F59_filtered_features.tsv.gz,存储经过质量控制后的基因表达计数信息 - 网页摘要文件(.html格式): - 以"_web_summary.html"为后缀的文件,如F31B_web_summary.html、F31W_web_summary.html,展示CellRanger软件处理每个样本的结果摘要 - 校验文件: - md5sum.txt:TXT格式,包含各.gz文件的MD5校验值,用于验证文件完整性

数据来源

国家组学数据百科(https://www.biosino.org/node/project/detail/OEP002321

适用场景

  • 单细胞转录组数据分析:用于研究细胞异质性、细胞类型鉴定等
  • 生物信息学方法验证:可作为基准数据测试单细胞数据处理算法
  • 基因表达模式研究:分析不同样本间基因表达差异及细胞群体特征
  • 数据完整性验证:通过md5sum.txt校验文件确保数据传输或存储过程中未损坏
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 739.83 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。