数据集概述
本数据集为基于OME-Zarr格式的scMultipleX测试数据,包含0.5.0版本scMultipleX测量的预期值、额外空标签,以及可重建该数据集的Fractal工作流。共含3个文件,支持生物信息领域对OME-Zarr格式数据的测试与验证。
文件详解
- 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_mip.zarr.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:OME-Zarr格式压缩文件,包含心肌细胞分化周期1的最大强度投影(MIP)相关scMultipleX测试数据
- 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1.zarr.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:OME-Zarr格式压缩文件,包含心肌细胞分化周期1的完整scMultipleX测试数据
- fractal_workflow_example_OME_Zarrs.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含Fractal工作流配置,结构含'name'(工作流名称)、'task_list'(任务列表)字段,用于重建测试数据集
数据来源
Zenodo平台(https://zenodo.org/records/10257149)
适用场景
- OME-Zarr格式兼容性测试: 验证生物信息工具对OME-Zarr格式scMultipleX数据的读取、解析能力
- scMultipleX数据处理流程验证: 利用Fractal工作流文件测试数据重建、分析流程的正确性
- 生物医学图像数据格式研究: 研究OME-Zarr格式在单细胞多组学成像数据中的应用特性
- 数据标准化验证: 基于0.5.0版本scMultipleX测量预期值,验证数据标准化处理的一致性