数据集概述
本数据集为OMOP2OBO Measurement Mappings V1.0版本,包含OMOP标准测量概念(基于LOINC)与人类表型本体(HPO)、生物相关化学实体(CheBI)等7种OBO本体的映射关系。映射覆盖测试结果的所有参考范围水平,采用自动(含TF-IDF嵌入模型)与手动方式生成,并通过OWL构造器构建语义映射,记录映射类别与统计信息。
文件详解
- 文件名称:
OMOP2OBO_V1_Measurement_Mapping_LOINC2HPO_Oct2020.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含OMOP测量概念与多OBO本体的映射记录,涵盖映射类别(自动一对一概念、手动一对多等8类)、目标本体(HPO/CheBI等)、映射概念及逻辑构造(如补集、交集)、证据字段(记录LOINC2HPO原始映射的更新情况)。
数据来源
OMOP2OBO项目,基于OMOP通用数据模型V5.0及2020年9月14日下载的OBO Foundry本体
适用场景
- 医学术语标准化研究:用于OMOP标准测量概念与多OBO本体的语义对齐,支持医疗数据的跨系统集成。
- 临床表型分析:通过LOINC到HPO的映射,关联实验室检测结果与人类表型特征,辅助疾病表型研究。
- 生物医学本体应用:利用CheBI/CL等本体映射,分析测量物质、细胞类型等生物医学实体的语义关联。
- 医疗数据映射工具验证:为OMOP2OBO等术语映射工具的性能评估提供基准数据。
- 临床数据语义增强:通过本体映射丰富OMOP测量数据的语义信息,提升数据的分析价值。